Dazkarieh
To fold or to FOLD?
Finalmente está lançada a Newsletter Portugal@Folding. É mais um objectivo atingido na nossa ideia de chegar cada vez a mais pessoas e de divulgar um projecto tão louvável como o Folding@Home. "O Homem pensa, a obra nasce!". É uma frase que muito se adequa à nossa equipa. A interacção e alegria com que diariamente falamos, nos ajudamos mutuamente faz com que tudo seja possível.
Um pouco de História...
Sendo esta a primeira edição da newsletter, porque não um resumo de como a nossa equipa se formou?
Foi a 24 de Janeiro de 2004 que tudo começou, na Internet, mais especificamente no Fórum TechzonePT. Aqui foi criado um tópico a explicar o projecto, o qual rapidamente se tornou num sucesso.
O crescimento foi enorme. O nosso website foi criado, os responsáveis do Fórum criaram um sub-fórum para discutir-mos de livre vontade tudo o que estivesse relacionado com a nossa equipa, na zona onde se discutem alguns dos projectos de computação distribuída existentes, na qual está incluída, naturalmente, a Portugal@Folding.
Momentos como a entrevista na Bits&Bytes e a reportagem na SIC, marcaram e ainda marcam um grande crescimento. Ocupamos actualmente a 37ª posição mundial e contamos subir ainda bastante. Com a apoio de todos, podemos colocar o nome de Portugal entre os melhores. A Newsletter é mais um passo para isso...
O nosso site é um projecto que está constantemente em transformação. Foi remodelado recentemente e ainda temos muitas ideias em mente para irmos adicionando... para além de esperarmos por outras.
Tudo o que temos até hoje foi feito por membros da nossa equipa sem qualquer contrapartida. É assim que esperamos continuar...
by _RoCk_
Curtas Folding@Home
Prémio para Folding@Home : Os investigadores do F@H, Vishal Vaidyanathan e Nick Kelley ganharam o prémio para a melhor apresentação BCATS 2005 for Alzheimer's Disease. Este é o terceiro prémio que o F@H ganha no BCATS.
Fonte: http://www.stanford.edu/group/pandegroup/folding/awards.html
30/10 Os problemas de cálculo do Gromacs no OSX provavelmente já estão resolvidos. Os testes para averiguar potenciais erros serão feitos de forma gradual, mas acredita-se que já esteja tudo resolvido.
Fonte: http://folding.stanford.edu/news.html
20/10 A nova versão do BOINC (Boinc 5.2.2) recomendada já saiu, no entanto não é compatível com LHC e SZTAKI.
Fonte: http://www.techzonept.com/showthread.php?t=74342
19/10 Os responsáveis pelo F@H da Universidade de Stanford estão a mover alguns dos seus serviços web para um novo servidor, fah-web.stanford.edu. Por enquanto todos os sites alojados no vspx27.stanford.edu vão continuar disponíveis, mas em breve ficará inactivo. Podem consultar todos os sites em ambos os endereços.
Fonte: http://folding.stanford.edu/news.html
18/10 BoincView, Manager para todos os Hosts, aviso colocado pelo Mike.
Ver: http://boincview.amanheis.de/
Fonte: http://www.techzonept.com/showthread.php?t=74154
17/10 Para quem não conhece, têm aqui dois programitas que podem ser bastante interessantes, FAHView 1.1 e FAH Serve 1.0, o anuncio no nosso fórum foi feito pelo DekkeR.
Fonte:
by HecKel
Parar? Não...
No dia 21 de Outubro tivemos uma apresentação sobre o Folding@Home na Universidade de Évora, durante a Alantejo. Foi o Metro quem se deslocou ao local para a relizar e tudo correu bem. Estaremos sempre abertos a acções destas.
Por iniciativa do shello e com a colaboração de toda a team, foi criado um tópico na wikipedia sobre o Folding@Home em Português, e como podem ver ficou um excelente trabalho! Parabéns a ele e a todos que o ajudaram!
Ver: http://pt.wikipedia.org/wiki/Folding@home
Fonte: http://www.techzonept.com/showthread.php?t=74019
Foi criado um mapa no Frappr para a nossa equipa. Está em http://www.frappr.com/portugalatfolding, onde se poderão inserir no nosso mapa para que seja visível em mais um local toda a nossa força. Também existe um geral do Folding@Home - http://www.frappr.com/foldingathome - para que o nosso território fique minado no plano mundial.
Fonte: http://www.techzonept.com/showthread.php?t=75624
Como podem ver, a nossa newsletter está em funcionamento. Irá sair quinzenalmente e basta ir ao nosso site para a assinar. Divulguem esta iniciativa entre os vossos amigos, familiares, conhecidos. Podem também enviar notícias para que sejam colocadas na mesma. Para isso, basta enviar um e-mail para [email protected] .
Fonte: http://www.techzonept.com/showthread.php?t=74252
by HecKel & Dazkarieh
Dicionário Folding@Home
Com esta parte pretendemos que em todas as Newsletters se explique um termo usado no nosso mundo. Começamos pelo essencial: a WU.
WU = Work Unit = Unidade de Trabalho
Geralmente é identificada por dois itens: um nome legível (ex: Amber, Gromacs, Core, etc) e uma Work Unit ID, um número alfanumérico que é usado pela base de dados do projecto para localizar a Unidade de Trabalho, tanto quando é distribuída como quando os resultados do seu processamento são enviados de volta.
Tecnicamente, é uma porção de dados que um projecto precisa de analisar. Na realidade, nós, Comunidade Portugal@Folding enviamos as mesmas porções de dados que recebemos, mas já analisados.
O tamanho e conteúdo das WU’s dependem unicamente do projecto em causa, assim como o seu tempo de processamento. O tamanho pode variar de pequeno ( 200 a 500 KBytes) até muito grande (vários MBytes).
Para mais informação sobre a denominação e conteúdo dos projectos do Folding@Home : http://fah-web.stanford.edu/cgi-bin/allprojects#243.
by Albumina
Os verdinhos
Nesta 1ª newsletter temos que das as boas vindas a 45 novos “verdinhos”, e não me refiro à cor do nick no site do EOC, mas sim aos novos aderentes destas 2 ultimas semanas à “causa”.
Como ninguém me disse que não podia fazer comentários aos vossos nicks eu decidi fazer alguns aos mais originais, a saber:
www.bellyspin.com (www.bellyskin.com não foi encontrado. Por favor verifique o nome e tente outra vez)
www.maquinadigital.com
TENSHI
SysVoL
Tiago_Leite
SpeedDragon
Quitoso (É bom saber que marcas de prestigio já aderiram à nossa luta o que dá uma nova projecção à equipa)
rokusu
20920 (menos um número e era o pin do meu cartão)
Shinoda
Ricardommc
Dominus
tze (Bem vindo, eu sou o tjorge)
Pedro_Sanches
XPuFinG
jojo
cybertrancer
The_Vortex
Tomos
Arbee
ESRT
Francisco_Vieira
Petiz (este engana muito, diz que é petiz, mas já fuma, mais uma aderente ao #portugal@folding )
Nucho
SONGOBEFE
KOLORVIZE
joegomes
stalin (bem vindo, camarada)
lino_ri (hmmmm, será que os teus primos lino_rib e o linor mais abaixo, sabes que estás aqui ou é coincidência)
Berbesi
Gatlink99
Alex_
www.HiQ-PC.com
OC-Zone (pá, andas perdido o OC-Zone.com já tá muito à frente)
Blueflash
linor (ver comentário ao lino_ri que deve ser gajo bem disposto)
Tsioangyo (ias adorar conhecer o Dekker, se não entenderes vai ao IRC - #portugal@folding)
Ogamaras
_THE_BOSS_
carlos__carvalho_pica (enfermeiro, com certeza)
SwiftShadow
capuchao
AMD_POWER (apoio-te 100%, já agora estou a precisar de um X2 urgentemente, pode ser mesmo o 4400+)
Pedro_Valadares
lino_rib (ver comentário ao lino_ri que deve ser gajo bem disposto)
Spuntz
by Fontemourisca
Existe Sempre Alguém...
Como tudo na vida, existe sempre alguém que se destaca, alguém que faz algo mais, tanto para o bem como para o mal, neste caso existem pessoas que fizeram algo mais para o bem! Existem pessoas que decidiram fazer algo de bom, decidiram foldar, e no tempo que estiveram a foldar, tentaram foldar o máximo que puderam, deixando pc's 24 sobre 24 horas sempre a trabalhar para este grande projecto chamado folding. Dessas Pessoas há sempre algumas que merecem algum destaque... E os Mais Produtivos Desta Quinzena são:
-amigos_da_proteina
-funkyfolders
-www.overvoltage.pt
-www.*****.com
-www.drimmachine.com
-www.extreme-computers.pt
-www.ViPeR5000.net
-ch-informatica.com/forum
-tlrocha
-www.virtual-fusion.com
Parabéns a eles pelo desempenho prestado , e não menosprezando aquele que não aparecem aqui, mas que também contribuem imenso para a nossa comunidade... Sem eles, sem vocês, não eramos o que somos! Parabéns a todos Keep Folding
by The_7
Review Semanal
Esperamos todas as semanas fazer uma review a um software relacionada com o Folding para que todos possam ir conhecendo o que podem usar.
Assistente para foldar – EMIII
Introdução
O EMIII e um programa que permite monitorizar o progresso das WU, não só no nosso computador mas também em outros, bastante para isso que se encontrem na mesma rede.
O programa não é difícil de instalar e configurar, podem encontrar um guia bastante completo, escrito pelo nosso colaborador FELiYCORA no “link” abaixo:
http://www.techzonept.com/showthread.php?t=51300
Aqui dá para ver o aspecto global, já depois de configurado:
Neste ecrã dá para visualizar muitas informações úteis, como o tempo que leva cada WU, a que horas começou a foldar e quanto tempo irá demorar a terminar. É possível também ver um pequeno desenho da proteína.
Características do programa
Clicando no pequeno microscópio, assinalado na primeira imagem desta review, obtemos um menu de opções como este:
Aqui adiciona-se as várias consolas que pretendemos que o EMIII monitorize, tal como descrito no tutorial. É possível modificar o aspecto/comportamento das barras que mostram o progresso das WU, em "Frame Progressbar Options"
Podemos ver também os detalhes através do "Queue.dat file info" (clicando no botão rosa). O botão assinalado a azul permite ver a configuração presente no cliente consola (user, nº da team, machine id, etc). O botão assinalado a amarelo mostra o log de cada um dos clientes consola.
Outra das características mais interessantes deste programa é mesmo a possibilidade de converter os dados das proteínas que se encontram a foldar, para uma página .html que se pode publicar na web. Como é possível ver na imagem, o EMIII converte automaticamente todas as informações que aparecem anteriormente...
Para terminar, é possível também alterar o aspecto geral do programa e importar novas skins, aki está o aspecto da skin do Portugal@Folding
Conclusões
O EMIII é um programa bastante completo, como deu para verificar nesta review. Quem optar pelo cliente consola tem no EMIII uma boa escolha para ajudar a monotorizar o folding.
Este pequeno programa consegue apresentar todos os dados úteis e ao mesmo tempo exporta-los para um html, o que torna fácil a amostragem das proteínas.
Ao mesmo tempo o EMIII faz também o diagnóstico de problemas, mostrando um alerta caso alguma proteína não esteja a foldar correctamente.
O único pequeno inconveniente é não ser multiplataforma e só funcionar em windows, ao contrário de outros programas similares como o FahMon...mas isso fica para outra review
by El_UnOEsperamos todas as semanas fazer uma review a um software relacionada com o Folding para que todos possam ir conhecendo o que podem usar.
Assistente para foldar – EMIII
Introdução
O EMIII e um programa que permite monitorizar o progresso das WU, não só no nosso computador mas também em outros, bastante para isso que se encontrem na mesma rede.
O programa não é difícil de instalar e configurar, podem encontrar um guia bastante completo, escrito pelo nosso colaborador FELiYCORA no “link” abaixo:
http://www.techzonept.com/showthread.php?t=51300
Aqui dá para ver o aspecto global, já depois de configurado:
Neste ecrã dá para visualizar muitas informações úteis, como o tempo que leva cada WU, a que horas começou a foldar e quanto tempo irá demorar a terminar. É possível também ver um pequeno desenho da proteína.
Características do programa
Clicando no pequeno microscópio, assinalado na primeira imagem desta review, obtemos um menu de opções como este:
Aqui adiciona-se as várias consolas que pretendemos que o EMIII monitorize, tal como descrito no tutorial. É possível modificar o aspecto/comportamento das barras que mostram o progresso das WU, em "Frame Progressbar Options"
Podemos ver também os detalhes através do "Queue.dat file info" (clicando no botão rosa). O botão assinalado a azul permite ver a configuração presente no cliente consola (user, nº da team, machine id, etc). O botão assinalado a amarelo mostra o log de cada um dos clientes consola.
Outra das características mais interessantes deste programa é mesmo a possibilidade de converter os dados das proteínas que se encontram a foldar, para uma página .html que se pode publicar na web. Como é possível ver na imagem, o EMIII converte automaticamente todas as informações que aparecem anteriormente...
Para terminar, é possível também alterar o aspecto geral do programa e importar novas skins, aki está o aspecto da skin do Portugal@Folding
Conclusões
O EMIII é um programa bastante completo, como deu para verificar nesta review. Quem optar pelo cliente consola tem no EMIII uma boa escolha para ajudar a monotorizar o folding.
Este pequeno programa consegue apresentar todos os dados úteis e ao mesmo tempo exporta-los para um html, o que torna fácil a amostragem das proteínas.
Ao mesmo tempo o EMIII faz também o diagnóstico de problemas, mostrando um alerta caso alguma proteína não esteja a foldar correctamente.
O único pequeno inconveniente é não ser multiplataforma e só funcionar em windows, ao contrário de outros programas similares como o FahMon...mas isso fica para outra review
Um muito obrigado ao shello pelo banner, ao mariocunha pelo "esquema" e a todos os que se empenharam para que a newsletter fosse possível.
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