Boas!
Segundo algumas pesquisas que fiz, os quatro pinos que ficam livres, se ligarem o conector de 20 pinos nas novas boards serve como alimentação adicional para o CPU. O que não é grave, já que estas boards, para alem do ATX c/ 24 pinos ainda mantêm o conector adicional de 4 pinos junto ao CPU.
Isto serve como medida de transição pacifica para o novo ATX 2.0.
Assim, se a fonte for ATX 20 pinos basta ligar a ficha de 20 pinos no conector de 24 eligar opbrigatoriamente o conector adicional de 4 pinos no conector proprio junto do CPU.
Caso a fonte ja tenha os 24 pinos a ligação adicional é escusada.
Espero ter contribuido para o esclarecimento....
Cumprimentos
Ricardo