Visto que há muita gente com o cliente gráfico e que quer mudar para consola decidi fazer um tutorial para o fazerem correctamente. Este tutorial estava no meio de uma thread por isso achei por bem fazer uma thread só para ele.
Podem fazer esta passagem quando quiserem, mesmo que estejam a meio de uma WU

Depois disto aqui ficam as instruções:

1- Parar o cliente gráfico
2- Sacar o cliente consola daqui (http://www.stanford.edu/group/pandegroup/release/FAH502-Console.exe)
3- Meter o cliente na pasta do Folding
4- Apagar o ficheiro winFAH.exe
5- Mudar o caminho do atalho que está na pasta Arranque, no menu Iniciar para o da consola
6- Correr a consola

Se quiser mudar alguma configuração, recomendo apagar o ficheiro client.cfg que está na directoria antes de correr a consola. Quando a correr ela irá perguntar outra vez os dados de configuração. Se precisar de ajuda na configuração poderá seguir o tutorial feito pelo user Gleed nesta (http://www.techzonept.com/showthread.php?t=55095) thread.

Depois de ter a consola a correr, poderá escondê-la no system tray com a ajuda de um programa chamado HideIt.
Se fechar a janela de terminal a consola deixará de correr.
Para configurar o HideIt para esconder a janela de terminal leia o texto seguinte:

Texto adaptado do tutorial do Gleed: (http://www.techzonept.com/showthread.php?t=55095)

Para esconder a janela da consola, basta ussarem este simples programa:
Primeiro fazer o download do programa HIDEIT
Download: HIDEIT (http://www.expocenter.com/hideit/hideit11.zip)

Descompactá-lo e criar uma pasta para o programa onde quiserem.
Ex: C:\Programas\Hideit

Antes de o configurarmos vamos primeiro fazer com que sempre que ligamos o pc o folding arranque automaticamente e a sua janela fique oculta no ambiente de trabalho.

Para isso temos que criar os atalhos respectivos,isto é:
-Atalho do ficheiro executavel da consola “FAH502-Console.exe”
-Atalho do ficheiro executavel do HIDEIT“HIDEIT.EXE”

Depois de ter criado os atalhos basta alterar nome para melhor orientação visto estar a correr 2 consolas, mas já lá vamos. Agora colocá-los no arranque do sistema, para isso necessita de arrastar esses 2 atalhos para o arranque com esta na seguinte foto:

http://pwp.netcabo.pt/gleed/folding@home/arranque.JPG

Pronto agora basta configurar o HIDEIT
Ao executá-lo aparece um janela com todas as janelas abertas de momento no ambiente de trabalho e se clicarem em cima de cada uma elas ficam ocultas mas temporarioamente e pararece um (H) antes da janela selecionada, isto é, quando reiniciarem o pc as janelas voltam a estar no ambiente de trabalho, exemplo:

http://pwp.netcabo.pt/gleed/folding@home/Hideit1.JPG

Para que isso não aconteça é necessário no programa HIDEIT clicarem em CONFIGURE, aparece a seguinte janela:

(1)Colocar certo em todos os itens
http://pwp.netcabo.pt/gleed/folding@home/Hideit2.JPG

(2)Fazer New e escrever em New rule: o nome da janela neste caso é FAH502-Consola1, fazem OK
http://pwp.netcabo.pt/gleed/folding@home/Hideit3.JPG

(3)Como tenho 2 consolas também vou colocar segunda consola FAH502-Consola2, seguindo o mesmo processo e por fim fazer OK OK como no exemplo:
http://pwp.netcabo.pt/gleed/folding@home/Hideit4.JPG

Depois disto não terão de se preocupar mais com a consola.
Caso tenham um algum problema, é só dizer.

http://pwp.netcabo.pt/dekker/techzone/keepfolding.gif