Viva, estou a usar como charset UTF-8, e na base de dados escrevia o texto correctamente.
-> tudo OK.

Agora que fiz o download de um backup da base de dados e as entradas na tabela tem a acentuação trocada, não dando para implementar em futuras, falhei algum passo ou estou a proceder incorrectamente?

Agradecido.

dado que na base de dados encontraste tudo ok com os acentos, entao o problema será no programa ou maneira como estás a fazer o backup da BD.