Boas, já tentei falar com alguns entendidos, já coloquei noutros foruns e ainda n consegui resolver o meu problema.

Quero criar um site centrado com laterais da medida do site como demonstra a figura, a vermelho o header e o footer e a verde as laterais que acompanham o movimento do site.

http://img175.imageshack.us/img175/7963/exemplooq7.jpg

Consigo colocar as laterais no sitio, mas faço repeat-y mas só repete +- a medida que está a azul não desce mais, alguem me pode ajudar?

Tens de dar altura às laterais... ou então enche com conteúdo.
Tena procurar no google por algo do género "3 columns css layout", de certeza que encontras soluções já testadas.

http://css-discuss.incutio.com/?page=ThreeColumnLayouts

Penso que não faltarão aqui exemplos para resolver o teu problema. :)